Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Efhd1Q9D4J1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Efhd1Q9D4J1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms