Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Sgms2Q9D4B1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sgms2Q9D4B1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sgms2Q9D4B1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Sgms2Q9D4B1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sgms2Q9D4B1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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