Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

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Length 713 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt44Q9D2Q2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Trmt44Q9D2Q2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt44Q9D2Q2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt44Q9D2Q2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trmt44Q9D2Q2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Trmt44Q9D2Q2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Trmt44Q9D2Q2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Trmt44Q9D2Q2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Trmt44Q9D2Q2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Trmt44Q9D2Q2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trmt44Q9D2Q2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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