Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Batf3Q9D275 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms