Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1G1

Rab1b, Ras-related protein Rab-1B, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1bQ9D1G1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rab1bQ9D1G1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rab1bQ9D1G1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms