Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Syf2Q9D198 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Syf2Q9D198 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms