Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Zbed3Q9D0L1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Zbed3Q9D0L1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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