Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pbdc1Q9D0B6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pbdc1Q9D0B6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms