Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mdm1Q9D067 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mdm1Q9D067 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms