Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Utp11Q9CZJ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Utp11Q9CZJ1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms