Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ssbp2Q9CYZ8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ssbp2Q9CYZ8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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