Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmed5Q9CXE7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed5Q9CXE7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms