Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CWU4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Q9CWU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9CWU4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9CWU4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms