Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ddx28Q9CWT6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ddx28Q9CWT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms