Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdca4Q9CWM2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdca4Q9CWM2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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