Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NubplQ9CWD8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NubplQ9CWD8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms