Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smc3Q9CW03 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smc3Q9CW03 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms