Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rprd1bQ9CSU0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms