Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nkiras2Q9CR56 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nkiras2Q9CR56 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms