Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q9CR55 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CR55 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Q9CR55 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CR55 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Q9CR55 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Q9CR55 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CR55 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CR55 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CR55 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q9CR55 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CR55 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CR55 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms