Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ska2Q9CR46 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ska2Q9CR46 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms