Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Psmd9Q9CR00 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd9Q9CR00 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms