Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nicn1Q9CQM0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nicn1Q9CQM0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nicn1Q9CQM0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms