Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudt21Q9CQF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nudt21Q9CQF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nudt21Q9CQF3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms