Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpl17Q9CPR4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpl17Q9CPR4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms