Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Bcl11bQ99PV8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Bcl11bQ99PV8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms