Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf8Q99PV0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf8Q99PV0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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