Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cep41Q99NF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cep41Q99NF3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms