Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Pcgf6Q99NA9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pcgf6Q99NA9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms