Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PccbQ99MN9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PccbQ99MN9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms