Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nkd1Q99MH6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nkd1Q99MH6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms