Protein–RNA interactions for Protein: Q99M87

Dnaja3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja3Q99M87 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dnaja3Q99M87 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dnaja3Q99M87 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms