Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Nmd3Q99L48 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nmd3Q99L48 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms