Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q99KU6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q99KU6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q99KU6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q99KU6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q99KU6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q99KU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q99KU6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q99KU6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q99KU6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q99KU6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.1 ms