Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rnf34Q99KR6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rnf34Q99KR6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms