Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp11Q99K46 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp11Q99K46 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms