Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smim11aQ99J19 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smim11aQ99J19 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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