Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rtn4ip1Q924D0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rtn4ip1Q924D0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms