Protein–RNA interactions for Protein: Q923B3

Nrif1, Neurotrophin receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrif1Q923B3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nrif1Q923B3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nrif1Q923B3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms