Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tubb6Q922F4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tubb6Q922F4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms