Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Snx18Q91ZR2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms