Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Snx4Q91YJ2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx4Q91YJ2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms