Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Creb3l3Q91XE9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Creb3l3Q91XE9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms