Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Csde1Q91W50 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Csde1Q91W50 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Csde1Q91W50 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms