Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI88

Odf4, Outer dense fiber protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf4Q8VI88 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Odf4Q8VI88 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Odf4Q8VI88 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms