Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cul7Q8VE73 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cul7Q8VE73 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cul7Q8VE73 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms