Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TgdsQ8VDR7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TgdsQ8VDR7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TgdsQ8VDR7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TgdsQ8VDR7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms