Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fam20bQ8VCS3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fam20bQ8VCS3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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