Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trpm8Q8R4D5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trpm8Q8R4D5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms