Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3I3

Cog6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, mousemouse

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Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog6Q8R3I3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cog6Q8R3I3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cog6Q8R3I3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms